Георгий Иванович Хлыновский,
руководил институтом в 1934-1937 гг.
Юлий Юльевич Марти,
руководил институтом в 1940-1941 гг.
Параскева Степановна Виноградова,
руководила институтом в 1941 г.
Георгий Константинович Ижевский,
руководил институтом в 1943-1948 гг.
Александр Николаевич Роганов,
руководил институтом в 1948-1949 гг.
Иван Иванович Лагунов,
руководил институтом в 1949-1958 гг.
Юрий Сергеевич Покровский,
руководил институтом в 1958-1960 гг.
Аркадий Павлович Алексеев,
руководил институтом в 1962-1974 гг.
Виктор Сергеевич Злобин,
руководил институтом в 1974-1976 гг.
Василий Петрович Пономаренко,
руководил институтом в 1977-1981 гг.
Георгий Иванович Лука,
руководил институтом в 1982-1991 гг.
Александр Васильевич Родин,
руководил институтом в 1991-1992 гг.
Федор Михайлович Трояновский,
руководил институтом в 1992-2002 гг.
Александр Иванович Болтнев,
руководил институтом в 2002-2004 гг.
Борис Федорович Прищепа,
руководил институтом в 2005-2012 гг.
Юрий Михайлович Лепесевич,
руководил институтом в 2012-2013 гг.
Константин Владимирович Древетняк,
руководил институтом в 2013-2017 гг.
Александр Владимирович Полянский,
руководил институтом в 2018-2019 гг.
С 2019 г. Полярным филиалом руководит доктор биологических наук Вячеслав Анатольевич Мухин.